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乌干达的主要税种是个人和企业所得税，以及增值税（VAT）。与其他撒哈拉以南非洲国家相比，乌干达的税收较低，平均占国内生产总值（GDP）的23％左右，占2008-2009财年GDP的11.9％。
个人所得税
乌干达居民必须就其全球收入缴纳个人所得税。此外，乌干达的非居民，其收入来自乌干达的来源，需要缴纳税款。就税收而言，如果乌干达居民是乌干达的居民，如果他们是乌干达雇员或在国外的官员，如果他们在纳税年度之后在乌干达居住183天，或者如果他们连续三年在乌干达平均每年122天。
企业所得税
乌干达还对居民企业的全球收入征收所得税。与个人所得税一样，非居民公司仅对来自乌干达的收入征税。除矿业公司以外的所有企业的税率为30％。矿业公司的所得税使用公式计算，并取决于公司的应课税收入和总收入，但税率必须至少为25％，最多为45％。
乌干达已确定小企业的特殊税率，年销售额在500万至5000万乌干达先令之间。这些特殊费率根据企业的总收入确定。
增值税
应纳税人，每种进口商品以及任何人提供的任何进口服务的每个应税供应都需要增值税（VAT）。应税供应品是根据纳税人的商业活动而制造的商品或服务。应纳税人是指在一年中的三个日历月内制作或预计制造价值为年度登记门槛四分之一的应税物资的人。纳税人必须注册。截至2010年7月，年度登记门槛为五千万乌干达先令。乌干达的增值税标准税率为18％。